TS Trần Hữu Hiệp, chuyên gia thủy sản cho rằng, khó khăn lớn nhất trong đại dịch chính là vấn đều lưu thông hàng hóa tại ĐBSCL. Bởi nhìn bề ngoài là sự lưu thông bị đứt gãy, nhưng bên trong thì đó là sự yếu kém, đứt gãy của chuỗi logistics nông sản.

Còn nhớ thời điểm cá tra đang xuất khẩu rất tốt, hầu hết các doanh nghiệp làm ăn có lãi, vấn đề xây dựng cảng cá và hệ thống kho lạnh được quan tâm, nhiều doanh nghiệp hăm hở đầu tư, đặc biệt là đầu tư vào cảng Hiệp Phước, TP Hồ Chí Minh. Song việc cá tra tiêu thụ khó trong thời gian dài làm cho quá trình hiện đại hóa chuỗi logistics của ngành cá tra nói riêng và của ngành thủy sản nói chung đã bị đình trệ. Thậm chí một số doanh nghiệp đầu tư kho lạnh hàng trăm tỷ đồng, thiết bị hiện đại nhưng đã bị phá sản. Khi không có hệ thống bến bãi kho lạnh đủ lớn, dịch bệnh xảy ra, các nhà máy không dám sản xuất nhiều, vì khó tiêu thụ. Do đặc trưng của việc kiểm định chất lượng xuất khẩu nên phần lớn kho lạnh ngành thủy sản phải gắn liền với các cảng biển. Các doanh nghiệp ngành thủy sản cho biết, do hệ thống kho bãi thiếu nên đa số doanh nghiệp phải vận chuyển lên TP Hồ Chí Minh để làm thủ tục xuất khẩu. Đại diện Công ty CP Tập đoàn Thủy sản Minh Phú từng cho rằng, nếu có dịch vụ tiếp vận hậu cần hợp lý hơn, hàng hóa có thể xuất khẩu trực tiếp từ ĐBSCL, không phải đưa lên TP Hồ Chí Minh, doanh nghiệp sẽ tiết kiệm được một khoản chi phí rất lớn, từ 30 – 40%.