Về phương án xử phạt theo Nghị định số 38 đã quy định rất cụ thể, chi tiết về hành vi vi phạm; thẩm quyền của các cơ quan, đơn vị, cá nhân trong việc lập biên bản vi phạm hành chính, xử phạt hành chính và phân định thẩm quyền xử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực thủy sản. Nghị định số 38 cũng đã quy định rõ thẩm quyền xử lý các hành vi vi phạm liên quan khai thác IUU của cơ quan, đơn vị như: Chủ tịch UBND cấp xã, cấp huyện và cấp tỉnh; Bộ đội Biên phòng; Công an; thanh tra chuyên ngành, kiểm ngư.
Ông Lê Văn Chơn – Phó Chủ tịch UBND TP.Phan Thiết cho biết, đối với tổ chức đăng ký cho tàu cá “3 không” thì Chi cục Thuế TP. Phan Thiết sẽ có những hướng dẫn các cá nhân có tài sản là tàu cá “3 không” thực hiện các thủ tục về việc kê khai lệ phí trước bạ đối với tàu thuyền đánh bắt thủy sản để đăng ký, đăng kiểm nhằm đưa vào quản lý. Nhiệm vụ của các phường, xã có nghề cá cũng phải hỗ trợ hướng dẫn người dân trong việc đăng ký theo các biểu mẫu quy định và hoàn thành trong tháng 9, nếu địa phương nào không hoàn thành phải chịu trách nhiệm.
Đối với việc quản lý nhóm tàu cá có nguy cơ vi phạm vùng biển nước ngoài, ông Lê Văn Chơn yêu cầu các địa phương phối hợp với 2 Đồn Biên phòng Mũi Né và Thanh Hải rà soát lại số lượng; đồng thời phân công cán bộ phụ trách để theo dõi di biến động của các phương tiện này từng ngày, từng tuần. Đây là động thái quyết liệt của chính quyền thành phố, thực hiện nghiêm túc chỉ đạo của Trung ương và của tỉnh về nhiệm vụ trọng tâm, cấp bách chống khai thác IUU, khắc phục khuyến nghị của EC trong công tác quản lý đội tàu cá, nhằm gỡ cảnh báo “Thẻ vàng” của EC.